1.打开太阳能热水器进水口；
2.太阳能热水器除垢剂加入到存水箱；
3.自动热循环20-30分钟，使除垢剂溶液充分接触各部位；
4.打开排水口，排干清洗液；
5.将水箱加满水后再循环两分钟；
6.排干循环水，清洗除垢工作完成。
静电除垢法：静电水垢控制器是利用一定强度的静电场进行水处理的设备。当水通过静电水垢控制器时，水在其电场的使用下产生极化，并使水偶极子的正极端趋向静电场的阴极，负极端趋向静电场的阳极，且按正负的次序被整齐地排列起来；当水中含有溶解盐时，这些盐类的正负离子就被若干水偶极子所包围，使其不能在水中自由游动，这样，这些溶解盐的离子就不能接触器壁，因而达到控制水垢生成的目的。
声学除垢法：声学除垢技术是在太阳能热水系统的设备内部激发和维持声频震荡，同时将声波传递给水介质进行除垢。超声波（1200～2500HZ）能使管道及设备的旧积垢逐渐剥落，并使硬度盐在水中结晶、并生成无粘性的粉末沉淀。
太阳能热水器用户不知道，太阳能热水器运用二年以上水箱内都会有一层水污。这是由于水中溶有一定数量的钙镁盐类，如碳酸氢盐、碳酸盐等一同还富含泥沙和有机物等，这些盐类在受热进程中发生物理和化学变化而构成水垢，就像我们用电开水壶烧开水一样久了都会看到有一层水污。水中富含碳酸氢钙在水温添加进程中会分解生成难溶的碳酸钙。