对于投标保函的金额，一般在招标文件中明确规定为投标报价的2%或以上，对于大型土建工程，也可以规定某一固定数值如30万美元等。
投标商向银行申请开具保函时，应严格按照招标文件规定的数额申请开列，在评标实践中，评标委员对于那些投标保函金额不足的，哪怕只差一分，也会予以废标。
投标保函格式不符合招标文件要求
对于投标保函格式，主要是指投标保函的担保条件，即：
1． 如果委托人在投标书规定的投标有效期内撤回其投标；
2． 如果委托人在投标有效期内收到雇主的中标通知后：
（a） 不能或拒绝按投标须知的要求（如果要求的话）签署合同协议；
（b） 不能或拒绝按投标须知的规定提交履约保证金，
而雇主指明了产生上述情况的条件，则本行在接到雇主的次书面要求就支付上述数额之内的任何金额，并不需要雇主申述和证实他的要求。
对于上述投标保函格式，投标商在向银行申请开列时，不得更改。任何更改都将导致废标。
独立性保函是二战后为适应当代国际贸易发展的需要，由银行和商业实践的发展而逐步确立起来的，并成为国际担保的主流和趋势，原因主要在于：，从属性保函的发生索赔时，担保银行须调查基础合同履行的真实情况，这是其人员和专业技术能力所不能及的，且会因此被卷入到合同纠纷甚至诉讼中。银行为自身利益考虑，绝不愿意卷入到复杂的合同纠纷中，使银行的利益和信誉受到损坏，而趋向于使用独立性保函。而且银行在处理保函业务时，正越来越多地引进信用证业务的处理原则，甚至有的将保函称为担保信用证。第二，独立性保函可使受益人的权益更有保障和更易于实现，可以避免保函申请人提出各种原因如不可抗力、合同履行不可能等等来对抗其索赔的请求，避免对违约人起诉所花费大量的金钱、精力及诉讼旷日持久等缺陷，可确保其权益不至因合同纠纷而受到损害。
付款保函是指担保银行应买方的申请而向卖方出具的，保证买方履行因购买商品、技术、专利或劳务合同项下的付款义务而出具的书面文件。 付款保函应买方、业主等申请，向卖方、施工方保证，在卖方、施工方按合同提供货物、技术服务及资料或完成约定工程量后，如买方、业主不按约定支付合同款项，则银行接到卖方、施工方索偿后代为支付相应款项